有机颜料和无机颜料着色力的差异是产生颜色的机理不同而造成的，由两者的基本化学结构不同引起。

有机颜料对色的呈现是结构中存在一个共轭双键体系（π电子体系）发色基团，共轭双键的电子通过选择吸收可见光从基态跃迁到激发态，因此有机颜料显示的色彩是互补的颜色。

无机颜料不含任何双键或者发色基团，所有化学元素都由环绕着（负）电子的正原子核（质子）组成。核的大小和电子的数目由元素在周期表中的位置决定。在周期表中所有元素是根据它们原子数目周期性循环的性质定位的，这样就决定了电子数目和电子层排列。电子能从基态跃迁到激发态，即从较低的能级跃迁到较高的能级，是需要一定的能量的。

从激发态到低能级（基态）的跃迁会产生一系列发射谱线，当这些发射谱线的波长处在可见光范围内时就能看见颜色。

无机颜料发射光的强度与有机颜料中的共轭双键产生的光的强度相比较低，这正是无机颜料着色力非常低的原因。

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